MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4c

Total Repeats: 3348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_011984	GAA	2	6	132767	132772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083251
2002	NC_011984	TC	3	6	132799	132804	0 %	50 %	0 %	50 %	222083251
2003	NC_011984	GAT	2	6	132852	132857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083251
2004	NC_011984	CGCC	2	8	132901	132908	0 %	0 %	25 %	75 %	222083251
2005	NC_011984	AAC	2	6	132930	132935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083251
2006	NC_011984	GC	3	6	132952	132957	0 %	0 %	50 %	50 %	222083251
2007	NC_011984	AAC	2	6	132975	132980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083251
2008	NC_011984	AAG	2	6	132987	132992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083251
2009	NC_011984	CAT	2	6	132998	133003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083251
2010	NC_011984	CAA	2	6	133010	133015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083251
2011	NC_011984	GAA	2	6	133037	133042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083251
2012	NC_011984	AAG	2	6	133149	133154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083251
2013	NC_011984	ACG	2	6	133173	133178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083251
2014	NC_011984	GCC	2	6	133182	133187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083251
2015	NC_011984	TCG	2	6	133210	133215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083251
2016	NC_011984	GTC	2	6	133236	133241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083251
2017	NC_011984	GAC	2	6	133320	133325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083251
2018	NC_011984	CGC	2	6	133427	133432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083251
2019	NC_011984	GCTT	2	8	133457	133464	0 %	50 %	25 %	25 %	222083251
2020	NC_011984	CGG	2	6	133524	133529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083251
2021	NC_011984	GTT	2	6	133548	133553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083251
2022	NC_011984	CTT	2	6	133589	133594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083251
2023	NC_011984	GGC	3	9	133649	133657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083251
2024	NC_011984	TGC	2	6	133672	133677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083251
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2026	NC_011984	CGAG	2	8	133771	133778	25 %	0 %	50 %	25 %	222083251
2027	NC_011984	GGA	2	6	133832	133837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083251
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2029	NC_011984	TCGA	2	8	133861	133868	25 %	25 %	25 %	25 %	222083251
2030	NC_011984	GCGA	2	8	133875	133882	25 %	0 %	50 %	25 %	222083251
2031	NC_011984	TCCG	2	8	133898	133905	0 %	25 %	25 %	50 %	222083251
2032	NC_011984	GAT	2	6	133914	133919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083251
2033	NC_011984	CGA	2	6	133961	133966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083251
2034	NC_011984	CGG	2	6	133987	133992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083251
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2036	NC_011984	CTCA	2	8	134133	134140	25 %	25 %	0 %	50 %	222083252
2037	NC_011984	AAG	2	6	134185	134190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083252
2038	NC_011984	TCG	2	6	134321	134326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083252
2039	NC_011984	GATCG	2	10	134391	134400	20 %	20 %	40 %	20 %	222083252
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2041	NC_011984	GAGGG	2	10	134551	134560	20 %	0 %	80 %	0 %	222083252
2042	NC_011984	CCG	2	6	134593	134598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083253
2043	NC_011984	TGC	2	6	134686	134691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083253
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2051	NC_011984	CGG	2	6	134963	134968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083253
2052	NC_011984	TGC	2	6	135010	135015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083253
2053	NC_011984	GGC	2	6	135024	135029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083253
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2055	NC_011984	GTG	2	6	135234	135239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083253
2056	NC_011984	ATC	3	9	135259	135267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083253
2057	NC_011984	GAT	2	6	135281	135286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083253
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2059	NC_011984	CAT	2	6	135312	135317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083253
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2061	NC_011984	GCTTCG	2	12	135367	135378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083253
2062	NC_011984	GC	3	6	135390	135395	0 %	0 %	50 %	50 %	222083253
2063	NC_011984	TGC	2	6	135398	135403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083253
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2066	NC_011984	TCT	3	9	135472	135480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083254
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2090	NC_011984	TCGGC	2	10	136965	136974	0 %	20 %	40 %	40 %	222083255
2091	NC_011984	GC	3	6	137015	137020	0 %	0 %	50 %	50 %	222083255
2092	NC_011984	CGA	2	6	137053	137058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083255
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2099	NC_011984	CGT	2	6	137816	137821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083256
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2106	NC_011984	CGG	2	6	138114	138119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083256
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2112	NC_011984	GCC	2	6	138385	138390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083256
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2119	NC_011984	GTCCA	2	10	138603	138612	20 %	20 %	20 %	40 %	222083257
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2121	NC_011984	CGGC	2	8	138766	138773	0 %	0 %	50 %	50 %	222083257
2122	NC_011984	GGACGA	2	12	138878	138889	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222083257
2123	NC_011984	TCG	2	6	138901	138906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083257
2124	NC_011984	CG	3	6	138918	138923	0 %	0 %	50 %	50 %	222083257
2125	NC_011984	CG	3	6	138928	138933	0 %	0 %	50 %	50 %	222083257
2126	NC_011984	ATG	2	6	138951	138956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083257
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2128	NC_011984	CGTGAT	2	12	139266	139277	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222083257
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2132	NC_011984	CAT	2	6	140173	140178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083258
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2134	NC_011984	CCG	2	6	140268	140273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083258
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2232	NC_011984	CG	3	6	144872	144877	0 %	0 %	50 %	50 %	222083266
2233	NC_011984	CT	3	6	144899	144904	0 %	50 %	0 %	50 %	222083266
2234	NC_011984	CCT	2	6	145003	145008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083266
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2237	NC_011984	GGTT	2	8	145145	145152	0 %	50 %	50 %	0 %	222083266
2238	NC_011984	TCC	2	6	145192	145197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083266
2239	NC_011984	TGGCC	2	10	145339	145348	0 %	20 %	40 %	40 %	222083267
2240	NC_011984	CGA	2	6	145354	145359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083267
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2242	NC_011984	ATC	2	6	145417	145422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083267
2243	NC_011984	GTG	2	6	145444	145449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083267
2244	NC_011984	TGC	2	6	145532	145537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083267
2245	NC_011984	GAG	2	6	145540	145545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083267
2246	NC_011984	TGA	2	6	145823	145828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083267
2247	NC_011984	AAG	2	6	145867	145872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083267
2248	NC_011984	GACG	2	8	145950	145957	25 %	0 %	50 %	25 %	222083267
2249	NC_011984	ACC	2	6	145997	146002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083267
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2251	NC_011984	TCGAGC	2	12	146063	146074	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222083267
2252	NC_011984	TAGGCG	2	12	146087	146098	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222083267
2253	NC_011984	CG	3	6	146109	146114	0 %	0 %	50 %	50 %	222083267
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2265	NC_011984	GAT	2	6	146421	146426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083267
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2348	NC_011984	CAGA	2	8	149834	149841	50 %	0 %	25 %	25 %	222083269
2349	NC_011984	TGATC	2	10	149907	149916	20 %	40 %	20 %	20 %	222083269
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2351	NC_011984	GGC	2	6	149931	149936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083269
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2353	NC_011984	ACCG	2	8	149991	149998	25 %	0 %	25 %	50 %	222083269
2354	NC_011984	GCA	2	6	150012	150017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083269
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2357	NC_011984	CCGGTC	2	12	150142	150153	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222083269
2358	NC_011984	GCG	3	9	150191	150199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083269
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2360	NC_011984	CGC	2	6	150254	150259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083269
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2362	NC_011984	TGG	2	6	150346	150351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083269
2363	NC_011984	TCG	2	6	150368	150373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083269
2364	NC_011984	CAG	2	6	150379	150384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083269
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2479	NC_011984	CTGT	2	8	157132	157139	0 %	50 %	25 %	25 %	222083277
2480	NC_011984	TCA	2	6	157189	157194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083277
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2483	NC_011984	ATCCC	2	10	157348	157357	20 %	20 %	0 %	60 %	222083277
2484	NC_011984	AGG	2	6	157365	157370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083277
2485	NC_011984	TTG	2	6	157399	157404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083277
2486	NC_011984	AGA	2	6	157409	157414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083277
2487	NC_011984	GCA	2	6	157594	157599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083277
2488	NC_011984	GCA	2	6	157633	157638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083277
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2492	NC_011984	CGTC	2	8	158037	158044	0 %	25 %	25 %	50 %	222083278
2493	NC_011984	TGA	2	6	158052	158057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083278
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2496	NC_011984	T	6	6	158150	158155	0 %	100 %	0 %	0 %	222083278
2497	NC_011984	AGC	2	6	158274	158279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083278
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2500	NC_011984	TTC	2	6	158626	158631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083278

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